石河子大学第一附属医院病理科成立于1950年，是国内少有的集临床、科研、教学一体的病理科，科室已发展为疆内病理诊断水平高、技术全面的临床病理诊断中心之一。病理为医之本，是诊断的金标准。病理科先后入选卫生部国家级临床重点专科，国家双语示范课程，是新疆兵团病理专业医疗质量控制中心、远程会诊中心、兵团病理诊断专科联盟依托单位、兵团病理诊断临床医学研究中心、自治区及兵团重点学科，全国及兵团“两癌”筛查培训基地，病理住院医师和国家病理规范化医师培训基地。
病理科技术力量雄厚，学科队伍结构良好，现有病理工作人员27人，主任医师/教授5人，副主任医师/副教授3人；具有博士学位及博士在读5人，2名医师有海外知名大学留学经历。享受国务院政府津贴专家1人，兵团特聘专家1人，绿洲学者1人，兵团英才计划人选1人，多人入选全国病理专业委员会委员。