石大一附院心血管内科是医院创建的最早的科室之一。1955年心血管内科属内一组，1989年7月心血管内科独立（内二科），2006年4月心血管内科正式分为心内一科、心内二科。
心血管内二科是国家临床重点建设专科、兵团重点学科、石河子大学重点学科、兵团心脏起搏与介入中心、硕士研究生学位授予点、十三五自治区重点学科建设项目-重点学科方向；国家药物临床试验基地。
2006年心内二科在新疆兵团系统率先开展了CRT和ICD手术；目前科室开展的心房纤颤及室速射频消融手术在兵团医疗系统领先；科室在心力衰竭、心律失常、高血压、心肌疾病的诊断治疗方面技术雄厚。
经过多年发展，心血管二科团队先后开展的起搏电生理、先心病介入封堵术、复杂冠心病介入、急性心梗急诊冠脉介入、冠心病介入诊疗手术、心力衰竭器械治疗新技术、心脏埋藏式自动除颤器植入术，技术水平处于疆内前列。
1、电生理诊疗术
科室电生理团队率先独立在兵团医疗系统开展三维标测系统进行复杂心律失常如房颤、房扑、室速、室早、房速、室上速的射频消融；率先在兵团卫生系统开展房颤患者卒中预防的左心耳封堵术；常规开展房颤射频消融术、脉冲消融术及Marshall静脉无水酒精化学消融术，年射频消融例数近300例，位居兵团医疗系统领先。
2、起搏器植入术
在疆内较早开展了对病窦综合征、房室传导阻滞等缓慢性心律失常的永久起搏器植入术，率先开展了左束支区域起搏术，使心脏起搏更具生理性。在兵团系统率先开展了心室再同步化治疗（CRT/CRT-D），为心室收缩不同步的心力衰竭的患者提供了更合理的治疗手段，改善了患者的生活质量，延长了生命。率先在兵团系统开展了心脏埋藏式自动除颤器植入术，为恶性致死性心律失常的患者带来了先进有效的治疗方法。
3、复杂冠脉介入诊疗术
冠脉介入团队在慢性闭塞病变、左主干病变及分叉病变等高难度的复杂介入手术方面具备丰富的经验，常规开展冠状动脉血管内影像检查IVUS、OCT，进行冠状动脉精准诊疗，针对冠脉钙化病变开展冠状动脉切割球囊扩张术、振波球囊扩张术、棘突球囊扩张术，年PCI术超600例，我科作为胸痛中心的核心科室，有四组24小时随时待命的急性心肌梗死急诊冠脉介入团队，实现了院前、院内胸痛患者救治的无缝对接，挽救了大量急性心肌梗死患者的生命，改善了这些危重患者的预后。
4、先心病介入封堵术
率先在兵团医疗系统独立开展了房缺、卵圆孔未闭、室缺、动脉导管未闭等先心病介入治疗术，成功率高，并发症少，在兵团医疗系统领先。
5、其他特色技术
科室常规开展主动脉瓣狭窄和关闭不全的经导管主动脉瓣置换术；二尖瓣、三尖瓣关闭不全缘对缘修复术（钳夹术）；继发性高血压肾上腺采血术；高血压的经皮肾动脉交感神经节消融术；右心导管、左心导管检查术；经皮肺动脉交感神经节消融术，能基本覆盖心血管疾病的诊疗。
房颤射频消融术+左心耳封堵“一站式”手术+Marshall静脉无水酒精化学消融术
CRT/CRTD、ICD等起搏器植入术
冠脉介入诊疗术（钙化病变冲击波球囊扩张术）
先天性心脏病介入封堵术
经导管主动脉瓣置换术